《X档案第九季》是于2001年上映的美国电视剧《X档案》系列的第九季，由金·曼纳斯执导，克里斯·卡特编剧，主演包括吉莲·安德森、罗伯特·帕特里克、安娜贝丝·吉什、小詹姆斯·皮肯斯、露西·劳莱丝、布鲁斯·哈伍德、汤姆·布莱德伍德、迪恩·哈格鲁德和加利·艾尔维斯等。

第九季的剧情主要围绕特别探员Doggett的调查工作，他坚持调查一个环保署职员死亡的案件，不顾其他人的阻拦。这一季包含了多个独立的案件，如Doggett发现政府利用经分子改造后的氯胺来制造超级士兵；一个研究撒旦的前大学教授逃脱并计划实施报复；一个人能自由穿梭于平行宇宙，并在其中一个宇宙中杀害了Monica和Doggett；一个男孩因遗传而具有类似苍蝇的特殊生理结构，能招来虫子；一个银行家的记忆被清除，Doggett调查此案；一个FBI探员来杀死Scully的孩子，另一个崇拜UFO的组织绑架了William，企图保护他；一个小男孩会因为恐惧而产生幻想，这些幻想出的虫子能够真的把人杀死；一个医院的护工建造了一座医院的模型，脑死亡的病人的灵魂都会停留在其中直到死去；一个凶手依据数字命理学的计算结果来选择受害人；以及一个病毒能让人类变成半机械半生物的怪物。

这些案件充满了剧情、科幻、悬疑和惊悚元素，为观众带来紧张刺激的观看体验。