目前对于水葫芦最常见的治理方法是直接消灭：如打捞，但由于它的生长速度特别快，收效不太好。

比较合理的的方法是生物防治：如在圭亚那找到了一种吃水葫芦的海牛；一天能够吃45kg的水葫芦，在印度找到了吃水葫芦的蚱蜢和两种毛虫；宁波市农科院已成功引进专吃水葫芦叶片的水葫芦象甲。

但在引入天敌前，应进行详细地调查，防止再次受到外来物种侵害。