OK，难得在百度知道上看到一个正经的问题。

Bifidobacterium animalis 是1969年日本人Mitsuoka确认的一种细菌，1997年的时候Bifidobacterium lactis被Meile确认为一种新的细菌。

但是随后2000年有科学家发现这两种细菌DNA杂交率非常高，不同菌株之间都在80%以上，因此后者应该是前者的变种。

2004年的时候国际细菌系统分类学会议上，根据先来后到的原则，正式将Bifidobacterium lactis修改为Bifidobacterium animalis一个亚种。

因此，最规范的写法是：Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bb-12注意拉丁名是斜体。

当然，为方便计，你所说的两种名称作为平时交流时简略的说法也不是不能接受，大家都懂就行了。