有国家一级保护动物藏羚羊、野牦牛、藏野驴、白唇鹿、雪豹，二级保护动物盘羊、岩羊、藏原羚、棕熊、猞猁、兔狲、石貂、豺，省级保护动物藏狐等；鸟类48种，其中青藏区种类18种，有国家一级保护动物金雕、黑颈鹤，二级保护动物红隼、大鵟、秃鹫、藏雪鸡、大天鹅、省级保护动物斑头雁、赤麻鸭、西藏毛腿沙鸡等；爬行动物有青海沙蜴；鱼类有裸腹叶须鱼、小头裸裂尻鱼等6种，均为高原特有种。

还有一些昆虫和水生低等生物。